EDIT: Es mejor instalar LAVFilters ya que FFDShow está obsoleto
Eso no es cierto. Tenemos montones de archivos TS y se reproducen perfectamente en el reproductor multimedia y se cargan sin problemas en Custom Cuts.
Estás confundiendo varias cosas. El reproductor multimedia es solo un contenedor. Lo que reproduce o no reproduce está controlado por los códecs de medios Direct Show. Si Windows encuentra un códec compatible o envía el video al códec para que decodifique la transmisión y devuelva los datos sin procesar, que luego representa.
Hay dos tipos de códecs: códecs de contenedor y códecs de video.
TS es un contenedor que puede contener mpeg1, mpeg2, mpeg4, mpegH o cualquier otro formato de video compatible. Así que cuando el reproductor multimedia carga un archivo de video, lo primero que hace es intentar encontrar un códec de contenedor que admita la decodificación de contenedores TS. La capa de Direct Show y Media Foundation de Windows tiene soporte integrado para la mayoría de los contenedores comunes, excepto para MKV (por eso MCEBuddy incluye LAVFilters, que añade el códec necesario para que el reproductor multimedia cargue archivos MKV).
El siguiente paso es identificar el códec responsable de decodificar la transmisión de video (mpeg1/2/4/H, etc.). Nuevamente, Windows tiene soporte integrado a través de su capa de Media Foundation para la mayoría de los códecs, excepto para algunos poco comunes como flash o mpegH (por eso MCEBuddy viene con LAVFilters, que se integra muy bien con la capa de Media Foundation y los códecs de Direct Show para complementar lo que tiene Windows, y tiene una excelente interfaz para cambiar entre los códecs de Windows y los de LAVFilters).
Así que nada de esto tiene que ver con el reproductor multimedia, sino con cómo has configurado tu sistema.
Todos los problemas que enfrentan las personas están relacionados con los códecs que usan. No recomendamos el uso de shark o k-lite ni ninguno de los paquetes de códecs porque esencialmente destruyen la mitad del sistema de Media Foundation de Windows (literalmente deshabilitan la mitad de las cosas y a veces dañan el registro tan gravemente que ni siquiera se puede restaurar) e instalan códecs que no son compatibles con el marco de Direct Show, lo que básamente lo rompe todo.
Prácticamente no tenemos problemas en ninguna de nuestras máquinas de prueba con la mayoría de los archivos y Custom Cuts. Son instalaciones limpias de Windows sin paquetes de códecs personalizados.
Si quieres usar Custom Cuts, comienza con una instalación limpia de Windows y no instales ningún paquete de códecs a menos que estés seguro de que los necesitas.