Tal vez intente mirar el archivo comskip.ini que se está utilizando. A veces el predeterminado no funciona y necesita elegir otro. Aquí hay un enlace a algunos archivos ini que pueden adaptarse mejor a sus archivos.
http://www.kaashoek.com/comskip/viewforum.php?f=7
Tal vez el ini de CBS Famewolf funcione para este programa, ya que Dr. Quinn originalmente era de CBS. Personalmente he usado los archivos de Comcast y Wilky13 con éxito.
Esto puede ayudarle a ver los pasos para cambiar el archivo comskip.
Espero que esto le ayude.