Si miras los registros, durante el remuxing ffmpeg parece tener problemas con los flujos de audio y video. Por eso, cuando termina, una de las pistas de audio (deu) no se identifica correctamente y aparece sin canales de audio. Así que MCEBuddy la omite; de lo contrario, la conversión fallaría más adelante.
Básicamente, el dispositivo de grabación creó un flujo no conforme.
→ [mpeg2video @ 000001fc5f1b1060] Dimensiones de fotograma no válidas 0x0.
2018-03-26T17:18:09 MCEBuddy.AppWrapper.FFmpeg → Último mensaje repetido 1 vez
2018-03-26T17:18:09 MCEBuddy.AppWrapper.FFmpeg → [wtv @ 000001fc5f14ae60] Stream #5: no hay suficientes fotogramas para estimar la tasa; considere aumentar probesize
2018-03-26T17:18:09 MCEBuddy.AppWrapper.FFmpeg → Diseño de canal adivinado para el flujo de entrada #0.2: estéreo
Noté algunos de esos mensajes y no estaba del todo seguro de su significado—principalmente porque en otros lugares veo que ffprobe parece reconocer perfectamente los flujos—
Veré si puedo hacer un remux mediante VLC (reproduce todos los flujos de audio sin problemas)—
Puedes intentar marcar la casilla que dice Skip remuxing en la página de configuración avanzada de la tarea de conversión, a ver si eso te funciona mejor.