Transfirieré mi archivo de registro por FTP; si tienes un momento para revisarlo y darme una sugerencia, te lo agradecería mucho.
Parece ser un error con Handbrake, solo está leyendo los primeros 6 segundos de tu archivo:
2020-01-27T16:42:07 MCEBuddy.AppWrapper.Handbrake → + stream: C:\Program Files\MCEBuddy2x\working0\hbotest2pass-mcfinal1.ts
2020-01-27T16:42:07 MCEBuddy.AppWrapper.Handbrake → + duration: 00:00:06
Tenemos una versión actualizada de Handbrake en la versión BETA 2.5.3 que puede solucionar el problema, puedes probarla o cambiar tu perfil para que ffmpeg sea el primer codificador en lugar de Handbrake y debería solucionar tu problema.
Gracias por echarle un vistazo. Handbrake debe estar leyendo los últimos 6 segundos, ya que son los primeros segundos los que se están cortando.
He pasado horas ajustando el perfil de Handbrake, lo probaré con ffmpeg y veré si funciona con todas las mismas opciones.