Ich sehe keine Fehler als solche in deiner Konvertierung; du stößt auf das GOP-Framing-Problem.
Bitte aktualisiere außerdem auf die neueste BETA-Version, da sie einige Aktualisierungen enthält, die dir helfen könnten.
Es gibt einige Dinge, die wir ausprobieren können, um die GOP-Probleme zu umgehen, also fangen wir mit dem ersten an:
Ich sehe, dass dein Profil Folgendes nicht enthält:
PreConversionCommercialRemover=true
Die Option CommercialMergeTool=avidemux funktioniert nur, wenn die obige Option für Nicht-TS-Profile aktiviert ist.
Versuche, die obigen Optionen hinzuzufügen und führe dann deine Konvertierung erneut aus. Wenn du Probleme hast, poste dein Konvertierungsprotokoll hier zurück.