我又看了一下你的日誌，在第一個案例中，字幕是以隱藏字幕（closed captions）形式內嵌在 TS 串流裡。你當時使用的是自訂設定檔，指示 HandBrake 使用這些內建的隱藏字幕並保留它們，因此才能正常運作：
2019-09-27T08:19:21 MCEBuddy.AppWrapper.Handbrake → + subtitle tracks:
2019-09-27T08:19:21 MCEBuddy.AppWrapper.Handbrake → + 1, español, Closed Caption [CC608]
你可以嘗試在專家設定中啟用「跳過重新封裝（Skip remuxing）」選項，讓 HandBrake 直接處理原始 M4V 檔案，而非第二個案例中被重新封裝的 TS 檔案；這樣它或許就能偵測到內建字幕並加以利用。