Ik verplaats deze post naar een nieuw onderwerp.
Je kunt proberen comskip af te stemmen door een aangepast ini-bestand te maken voor je conversietaak. De bovenstaande link legt uit hoe je een aangepast ini-bestand voor comskip maakt.
Gebruik specifiek de comskip ini-editor, onder Global removes → aways_keep_first_seconds is de parameter die je wilt aanpassen. Dit vertelt comskip om de eerste X seconden van je programma over te slaan, zodat je dit probleem niet tegenkomt.
Hier kun je het vinden.
Wat betreft het probleem met de reboot/herstart, klinkt het als een probleem met de Windows-services. Ik raad aan om een nieuw onderwerp te starten om dat afzonderlijk te bespreken.